Στη δεύτερη φάση του Πρωταθλήματος θα συνεχίσουν 12 από τις 26 ομάδες που πήραν μέρος από την αρχή της χρονιάς. Να θυμίσουμε ότι από κάθε όμιλο της πρώτης φάσης, οι τρεις πρώτες ομάδες περάσανε στην επόμενη. Οι ομάδες των ομίλων Α΄ και Β΄ θα σχηματίσουνε τον όμιλο Ε΄, ενώ οι ομάδες των ομίλων Γ' και Δ' θα σχηματίσουνε τον όμιλο ΣΤ' , ως εξής :
Ε΄ ΟΜΙΛΟΣ
ΗΛΕΚΤΡΟΛΟΓΟΙ 4
ΔΑΣΟΛΟΓΙΑ 4
ΚΤΗΝΙΑΤΡΙΚΗ 3
ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΟ 3
ΦΥΣΙΚΟ 2
ΧΗΜΙΚΟ 2
ΣΤ΄ ΟΜΙΛΟΣ
ΜΑΘΗΜΑΤΙΚΟ 4
ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ 4
ΜΗΧΑΝΟΛΟΓΟΙ 3
ΠΟΛΙΤΙΚΟΙ ΜΗΧ. 3
ΙΑΤΡΙΚΗ 2
ΦΑΡΜΑΚΕΥΤΙΚΗ 2
Κάθε ομάδα μεταφέρει στη φάση αυτή τους βαθμούς από τους αγώνες που έδωσε με τις άλλες 2 ομάδες του ομίλου της (της πρώτης φάσης), που επίσης προκρίθηκαν στη δεύτερη φάση. Έτσι η μέγιστη βαθμολογία με την οποία μπορεί να ξεκινήσει μία ομάδα στη δεύτερη φάση είναι οι 4 βαθμοί (για δύο νίκες) και η ελάχιστη 2 βαθμοί ( για δύο ήττες).
Η κάθε ομάδα θα πάρει μέρος σε τρεις αγώνες, με τις ομάδες του νέου ομίλου της που δεν έχει αγωνιστεί ως τώρα.