Την Τετάρτη 10/10/12 έγινε η κλήρωση για το σχηματισμό των ομίλων του Πρωταθλήματος. Στη διαδικασία ήταν παρόντες εκπρόσωποι των 23 ομάδων που θα λάβουν μέρος στο φετινό Πρωτάθλημα στο οποίο θα συμμετάσχουν για πρώτη φορά 3 καινούργιες ομάδες.
Όπως κάθε χρόνο, οι 4 ομάδες που φτάσανε στο Final Four της προηγούμενης περιόδου τέθηκαν επικεφαλής των τεσσάρων ομίλων, ενώ οι ομάδες που φτάσανε στη φάση των "8"΄μπήκαν σε διαφορετικούς ομίλους.
Οι όμιλοι όπως προέκυψαν από την κλήρωση είναι οι εξής :
Α΄ ΟΜΙΛΟΣ
1) Μηχανολόγοι Μηχανικοί, Μαθηματικό, Γεωλογία, Χημικοί Μηχανικοί, Ιατρική 2, Φαρμακευτική
Β΄ ΟΜΙΛΟΣ
1) ΤΕΦΑΑ, Οικονομικό, Ιατρική, Πληροφορική, Φιλοσοφική 2, Νομική.
Γ΄ ΟΜΙΛΟΣ
1) Ηλεκτρολόγοι ΜΜΥ, Φιλοσοφική, Μηχανολόγοι Μηχανικοί 2, Φυσικό, Ιστορικό-Αρχαιολογικό, Μηχανικοί Χωροταξίας & Ανάπτυξης.
Δ΄ ΟΜΙΛΟΣ
1) Γεωπονική, Πολιτικοί Μηχανικοί, Δασολογία, Θεολογία, Κτηνιατρική.* Το πρόγραμμα των αγώνων θα ανακοινωθεί τις επόμενες ημέρες.