Την Τετάρτη 10/10/12 έγινε η κλήρωση για το σχηματισμό των ομίλων του Πρωταθλήματος. Στη διαδικασία ήταν παρόντες εκπρόσωποι των 23 ομάδων που θα λάβουν μέρος στο φετινό Πρωτάθλημα στο οποίο θα συμμετάσχουν για πρώτη φορά 3 καινούργιες ομάδες.
Όπως κάθε χρόνο, οι 4 ομάδες που φτάσανε στο Final Four της προηγούμενης περιόδου τέθηκαν επικεφαλής των τεσσάρων ομίλων, ενώ οι ομάδες που φτάσανε στη φάση των "8"΄μπήκαν σε διαφορετικούς ομίλους.
Οι όμιλοι όπως προέκυψαν από την κλήρωση είναι οι εξής :
 Α΄  ΟΜΙΛΟΣ
1) Μηχανολόγοι Μηχανικοί, Μαθηματικό,  Γεωλογία, Χημικοί Μηχανικοί, Ιατρική 2, Φαρμακευτική
 Β΄  ΟΜΙΛΟΣ
1) ΤΕΦΑΑ,  Οικονομικό,  Ιατρική,  Πληροφορική,  Φιλοσοφική  2,  Νομική.
Γ΄  ΟΜΙΛΟΣ
1) Ηλεκτρολόγοι ΜΜΥ,  Φιλοσοφική, Μηχανολόγοι Μηχανικοί 2, Φυσικό,  Ιστορικό-Αρχαιολογικό, Μηχανικοί Χωροταξίας & Ανάπτυξης.
Δ΄  ΟΜΙΛΟΣ
1) Γεωπονική, Πολιτικοί Μηχανικοί,  Δασολογία,  Θεολογία,  Κτηνιατρική.* Το πρόγραμμα των αγώνων θα ανακοινωθεί τις επόμενες ημέρες.

